北京城里呆了两个月，就结束了它的历史使命。李自成没有来得及带上长平公主，就在清军的追击下败逃远去。
清顺治二年，长平公主向顺治帝及摄政王多尔衮上书要求出家为尼，但清政府为了笼络人心，不但不答应，在长平公主上书不久，顺治帝就下达诏命：让她与崇祯为她选定的驸马周显完婚，并且同时赐予府邸、金银、车马、田地。但仅仅过了几个月，长平公主就病逝了，时为顺治三年，长平公主十八岁。赐葬广宁门外。
长平公主的下落有了结论，崇祯帝的儿子下落至今却还是个谜。
据《明史·诸王传》记载崇祯帝的一生共生有7个儿子。崇祯十七年（1644），李自成攻陷北京之时，皇太子朱慈烺16岁，皇三子定王朱慈炯14岁，皇四子慈炤只有十岁。除了这三个儿子外，崇祯帝的其他的儿子都是早夭。李自成大军攻破北京之日，崇祯帝为给大明保留一丝血脉。他让儿子们都换上平民的衣服，由太监护送逃出北京城。临死，他还写下遗诏，要求各地的官员协力辅佐太子，重振大明。
