考古发现，对于进一步肯定“东山陆桥”的学术观点，具有非同寻常的作用。尤玉柱教授在关于“东山陆桥”的学术著述中说：“‘东山陆桥’这个隆起地带，只要更新世时期气候稍为变冷，就会露出为陆地。因此，‘东山陆桥’就成为史前时期人类往来闽台之间的必经之地。漳州地区石制品和人骨化石的发现，进一步证实了‘东山陆桥’在闽台关系中的重要作用，也证实了漳州地区在人类迁往台湾过程中所起的桥头堡作用。”

台湾本岛的考古发现，也有力地证实“东山陆桥”的存在。在台湾的第四纪地层中，曾发掘许多哺乳动物化石，如东方剑齿象、剑齿虎、中国犀、古鹿、野牛、野猪等化石。这些都是同时期古漳州一带乃至华南地区常见的古动物。台湾的六十四种兽类、各种淡水鱼类、植物类，大多与大陆同谱系区系。这些都说明台湾和大陆本为同一古陆，本有陆地相通，动植物本是生存活动于同一圈层。“东山陆桥”正是古动物古植物跨越海峡的通途。台湾臧振华教授在关于台湾、澎湖史前文明考古报告中说，在迄今四至五千年期间，台湾海峡出现海退期，又露出陆桥，陆桥“上面有浅滩、沼泽及河流……这时候台湾海峡上的人群活动颇为频繁。澎湖、台湾，和大陆